Šiuo metu aktyviausiai bendradarbiaujama su žemiau išvardintomis organizacijomis. Tačiau NMA yra atvira dialogui ir su kitomis organizacijomis, kurioms svarbūs paramos žemės ūkiui, kaimo plėtrai ir žuvininkystei administravimo klausimai.
-
Lietuvos bitininkų sąjunga
-
Lietuvos braškių augintojų draugija
-
Lietuvos daržovių augintojų asociacija
-
Lietuvos ekologinių ūkių asociacija
-
Lietuvos galvijų veisėjų asociacija
-
Lietuvos grūdų augintojų asociacija
-
Lietuvos grūdų perdirbėjų asociacija
-
Lietuvos jaunųjų ūkininkų ir jaunimo sąjunga
-
Lietuvos jaunųjų ūkininkų ratelių sąjunga
-
Lietuvos kaimo bendruomenių sąjunga
-
Lietuvos kaimo turizmo asociacija
-
Lietuvos kiaulių augintojų asociacija
-
Lietuvos maisto pramonininkų konfederacija
-
Lietuvos mėsinių galvijų augintojų ir gerintojų asociacija
-
Lietuvos miško savininkų asociacija
-
Lietuvos paukštininkystės asociacija
-
Lietuvos pieno gamintojų asociacija
-
LR žemės ūkio rūmai
-
Lietuvos šeimos ūkininkų sąjunga
-
Lietuvos šiltnamių asociacija
-
Lietuvos ūkininkių draugija
-
Lietuvos ūkininkų sąjunga
-
Lietuvos verslo konfederacija
-
Lietuvos veterinarijos gydytojų asociacija
-
Lietuvos žemės savininkų sąjunga
-
Lietuvos žemės ūkio bendrovių asociacija
-
Lietuvos žemės ūkio ir maisto taryba
-
Lietuvos žemės ūkio technikos asociacija
-
Lietuvos žuvininkystės produktų gamintojų asociacija
-
Lietuvos žvėrelių augintojų asociacija
-
Privačių miškų savininkų asociacija
-
Vietos veiklos grupių tinklas
-
Asociacija ,,Alternatyvioji akvakultūra”
-
Lietuvos žuvininkystės produktų gamintojų asociacija
-
Lietuvos žuvininkystės regionų vietos veiklos grupių tinklas
-
Nacionalinė akvakultūros ir žuvų produktų gamintojų asociacija
-
Nacionalinė žuvų perdirbėjų ir prekybininkų asociacija
-
Priekrantės verslinės ir rekreacinės žuvininkystės asociacija
-
Vakarų Lietuvos žvejų ir žuvies perdirbėjų konfederacija
-
Žuvininkystes ir laivybos tarpšakinė organizacija
-
Žvejų ir žuvies perdirbėjų asociacija ,,Baltijos žvejas”
-
Žuvininkystės įmonių asociacija ,,Lampetra”
-
Žuvininkystės regionų vietos veiklos grupių tinklas
-
Kaimo plėtros ir verslo konsultantų asociacija
Nacionalinė mokėjimo agentūra prie Žemės ūkio ministerijos